שירות הביטחון הכללי החל לחקור את המחדל החמור בצה"ל, כאשר בלילה האחרון נגנבו עשרות אלפי כדורי תחמושת מבסיס צאלים, שבנגב. להיכנס לחקירה במשותף עם משטרת ישראל והמשטרה הצבאית, התקבלה במסגרת הכוונה להגביר את העיסוק של השב"כ בסוגיית ריבוי אמצעי הלחימה הבלתי חוקיים באזור.