הרב מנחם פרל יכהן כראש מכון צומת, כך החליט הוועד המנהל של עמותת צומת. מי שהציע את מועמדותו של הרב פרל כבר לפני חצי שנה היה הרב ישראל רוזן זצ"ל בעצמו, כשהתכוון לפרוש  חלקית מתפקידו במכון ולמנות ראש למכון לצידו.

הרב פרל פעל בחודשים האחרונים כמ"מ ראש המכון וכעת לאחר אירוע השלושים לזכרו של הרב רוזן, הוא  מונה לתפקיד רשמית. הרב מנחם פרל היה ראש מדור ההלכה ברבנות הצבאית במשך שנים רבות, בשנים האחרונות כיהן כרב הרשות לכבאות והצלה ובעבר כיהן כרב הישוב מעלה חבר.

פרופ' יוסף בודנהיימר, נשיא מכון לב בעבר וחבר הוועד המנהל של מכון צומת אמר כי הרב פרל ימשיך בע"ה בהצלחה את המפעל ההיסטורי שבנה הרב רוזן ז"ל, "הרב פרל הוא איש הלכה מובהק המחובר לעולם המעשה. בהנהגתו, ובאמצעות מהנדסי צומת ועובדיו, ימשיך המכון להתפתח ויוסיף לסייע לקיום  חיים יהודיים בעולם המודרני על פי ההלכה.

הרב פרל הודה להנהלה על הבחירה ואמר כי הוא רואה בתפקיד משימת קודש "כולנו עדיין הלומי צער אך נאמנים למורשתו של הרב רוזן לעמוד באתגר למען קיומה של מדינה יהודית ומודרנית תוך שמירת ההלכה".