הורה מרן ראש הישיבה זצוק"ל את הוראתו למנהלי הת"תים בעניין זה, ואמר: "יש להתנגד בתוקף לתקנות החדשות ולכל שינוי במצב שהיה עד כה, פשוט וברור שלא יעלה על הדעת כלל לחתום על מסמך כלשהו או לעשות איזו פעולה שתתפרש כהסכמה לתקנות החדשות המכפיפות את תלמודי התורה למשרד החינוך הכפרני, היה לא תהיה".

מרן ראש הישיבה זצוקללה"ה המשיך והורה למנהלים על הדרך בה יש לנהוג כאשר יידרשו לחתום על התקנות החדשות – וכפי שאכן אירע בימים אלו – ואמר: "כאשר יגיעו מסמכים המצריכים חתימה כלשהי והמתייחסים לתקנות החדשות, אזי אסור לחתום על שום מסמך שלהם; אסור להסכים לתקנות החדשות ולשום מסמך שעושה שינוי, ויש לעמוד על כך גם במחיר של ויתור על תקציבי משרד החינוך, כדי לעמוד על עצמאות מוחלטת".