פחות מעשרים וארבעה שעות מהכרעת הדין בפרשת אלאור עזריה והרמטכ"ל רא"ל גדי אייזנקוט שולח מסר ברור לעם ישראל "יש בתי דין שאין לי עליהם שום השפעה. הם מחפשים לעשות צדק ולהכתיב את הנורמות והכללים המשפטיים והם לא מושפעים ממני ועושים צדק. אצלנו יש בלבול עמוק בהבנה של מה התפקיד של כל גורם. גבר בן 18 שמתגייס לצה"ל הוא חייל ולא הבן של כולנו ועליו לחרף את חייו כדי לשמור עלינו" קובע ראש המטה הכללי והודף את הביקורת הציבורית כאילו הצבא משפיע על השופטים.
"כשחוצים את שערי הבקו"ם יש פקודות – חוקיות, בלתי חוקיות ובלתי חוקיות בעליל ואנחנו מסבירים לאנשים שלנו מה זה. כשהפקודה היא בלתי חוקית בעליל – זו לא זכותך לא לבצע אלא חובתך. אני יוצא מתוך נקודת הנחה שאנחנו נותנים פקודות חוקיות ונכונות, וזה מסביר מדוע אנחנו כמעט ולא נתקלים באירועים מהסוג הזה", סיכם הרמטכ"ל.
דובר משפחת אזריה אמר בתגובה לדברי הרמטכ"ל כי "ערב לפני הכרעת משפטו של אלאור אזריה, הרמטכ"ל מוצא מקום להתערב בצורה בוטה. אמת, הוא לא הבן של כולנו, אבל הוא החייל של כולנו. הרמטכ"ל כופר במשוואה הכל כך ברורה לכולם, שאנחנו שולחים את היקר לנו מכל מתוך אמונה שהוא מופקד בידיהם של מפקדים הראויים לכך".